Mittlerweile gibt es Wing Commander Modifikationen wie Sand am Meer. Hier folgt eine Liste der größten und bekanntesten Modifikationen:

Wing Commander Saga

Wing Commander Saga

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Modifikation für: Freespace 2
Info: ohne Freespace 2 lauffähig
Status: in Arbeit - Demo veröffentlicht

Eine Total Conversion von Freespace 2, die mit ihrer guten Graphik und ihrem abwechslungsreichen Missionsdesign überzeugen will. Der Prolog und zwei Demos sind bereits veröffentlicht.

Wing Commander Standoff

Wing Commander Standoff

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Modifikation für: Secret Ops
Status: in Arbeit - 4 Episoden veröffentlicht

Ein Addon für Wing Commander Secret Ops, von dem bereits vier Episoden erschienen sind. Die Story basiert auf dem Roman Fleet Action und das Gameplay lehnt an WC2 an.

Unknown Enemy

Wing Commander Unknown Enemy

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Modifikation für: Secret Ops
Status: fertig

Ein Addon für Wing Commander Secret Ops, in dem man auf Seiten der Grenzwelten in den Krieg gegen die Nephilem eingreift.

Wing Commander Pioneer

Wing Commander Pioneer

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Status: in Arbeit

Dieses ehrgeizige Projekt wird eine Art Privateer in der WC1-Ära. Es bietet hochauflösende Graphiken und soll Gameplaytechnisch viele Möglichkeiten bieten.

Privateer Remake

Wing Commander Privateer Remake

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Modifikation für: Vega Strike
Info: ohne Vega Strike lauffähig
Status: fertig

Plattformunabhängiger Clone von Wing Commander: Privateer für Linux, Mac und Windows

Privateer Remake Gemini Gold

Gemini Gold

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Modifikation für: Vega Strike
Info: ohne Vega Strike lauffähig
Status: fertig

Ebenfalls ein Multi-Plattform Privateer-Klon, ist aber stärker an das Original angelehnt als andere Remakes.

Privateer: Parallel Universe

Wing Commander Privateer Parallel Universe

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Modifikation für: Vega Strike
Info: ohne Vega Strike lauffähig
Status: fertig

Ein weiterer Ableger des Privateer Remake Projektes. Die aktuelle Version bietet unter anderem frische Waffen und Ausrüstung, neue Schiffe, verbesserte Texturen, veränderte Sounds sowie neue Missionen.

Flight Commander

Flight Commander

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Status: fertig

Eine neue Weltraumspiel-Engine im Stil von Wing Commander: Prophecy, inklusive graphischem Missionseditor und vielen Schiffen

Wing Commander: Battle Stations

Wing Commander Battle Stations

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Status: in Arbeit - Demo veröffentlicht

Dieser Top-down 2D-Shooter spielt während der WC1-Ära und verspricht actionreiches Gameplay. Eine Demo ist bereits verfügbar.

WC4 Homeworld 2 Mod

Homeworld 2 Mod

Web: -
Modifikation für: Homeworld 2
Status:  in Arbeit - Beta veröffentlicht

Der Ersteller dieses Mods hat es sich zur Aufgabe gemacht, Alle Schiffe der WC4-Ära in das Spiel Homeworld 2 zu konvertieren. Zur Zeit arbeitet er jedoch alleine an diesem Projekt, weswegen es keinen Releasetermin gibt.

WC Zone

Wing Commander Zone

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Modifikation für: Subspace
Status: fertig

Ein Mod für das Top-down Multiplayer Freeware-Spiel SubSpace.

Privateer - Ascii Sector

Privateer Ascii Sector

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Status: in Arbeit - Demo

Ein komplett textbasierter Privateer-Klon, alle Graphiken sind aus Ascii-Zeichen zusammengesetzt.

PiArmada

PiArmada

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Status: in Arbeit - Demo

Ein Wing Commander Armada Klon, der auf der Engine Pi4x für rundenbasierte Strategiespiele basiert. Das Spiel soll Plattformunabhängigund erweiterbar sein und alle Funktionen von Armada enthalten.

Holding The Line

Hold the Line

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Status: in Arbeit

Ein Fan Fiction Projekt, das während des Krieges gegen die Nephilem spielt. Die Fortsetzungen der Geschichte erscheinen wöchentlich.

Ranger's Glory

Wing Commander Ranger's Glory

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Modifikation für: Flight Commander
Status: angekündigt

Dieser Mod nutzt Ed Benowitz' Flight Commander Engine. Er basiert teilweise auf Unknown Enemy und seine Story spielt kurze Zeit vor bzw. während Unknown Enemy. 

Red Point

Wing Commander Redpoint

Web: Homepage
Modifikation für: Secret Ops
Status: angekündigt

Dieses Spiel verspricht 64 Missionen und zwei Episoden mit insgesamt acht Kapiteln

Wing Commander Invasion

Wing Commander Invasion

Web: -
Modifikation für: Star Trek: Armada
Status: eingestellt - Beta veröffentlicht

Eine Total Conversion für Star Trek: Armada, die neue Schiffe, Graphiken und eine neue Story enthält. Es war geplant, fast alle Punkte des ursprünglichen Spiels zu verändern.

Wing Commander X3

Wing Commander X3

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Modifikation für: X3
Status: Beta veröffentlicht

Dieser Mod liefert einige Schiffe aus dem Wing Commander Universum für die Wetraumhandels- und Kampfsimulation X3 von Egosoft.

Raiders

Wing Commander Raiders

Web: -
Status: eingestellt

Ein CGI Filmprojekt, das die Geschichte eines Terranischen Konvois zeigen sollte, der von Kilrathi angegriffen wird.

Rebell Assault

Wing Commander Rebell Assault

Web: Homepage
Status: eingestellt

Ein Wing Commander Renderfilm, in dem es um einen Kilrathi Clan nach dem Krieg gehen sollte, der das Imperium wieder aufbauen will und einen Angriff auf die Konföderation plant.

WC Tactics

Wing Commander Tactics

Web: -
Modifikation für: Nexus
Status: eingestellt

Das Strategiespiel Nexus bietet Moddern eine gute Engine, um einen Wing Commander Mod zu erstellen. Ein Wing Commander Fan namens Chevieblazer hat sich daran gemacht, Schiffe aus Wing Commander 1 und 2 einzubauen.

Wing Commander 2634

Wing Commander 2634

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Modifikation für: Nexus
Status: eingestellt

Auch dieser Mod benutzt die Nexus-Engine und plant, Designs von WC1-3 sowie der Fernsehserie und des Films zu kombinieren.

Fleet Action

Wing Commander Fleet Action

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Modifikation für: Homeworld 1
Status: eingestellt - Beta verfügbar

Ein Homeworld Mod mit Schiffen aus fast allen Wing Commander Äras.

Marine Corps

Wing Commander Marine Corps

Web: -
Modifikation für: Unreal Tournament
Status: eingestellt

Ein First-Person-Shooter auf der Basis von Unreal Tournament, mit neuen Modellen, Waffen und Levels

Time Crisis

Wing Commander Time Crisis

Web: -
Status: eingestellt

Dieses Spiel sollte sowohl im WC-Universum als auch in dem von Star Trek spielen, und im Stil eines 2D Spiels wie Duke Nukem oder Prince of Persia ablaufen.

Wing Commander: The Wasteland Incident

Wing Commander Wasteland Incident

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Modifikation für: Vega Strike
Status: eingestellt

Viel ist über dieses eingestellte Projekt in der Vega Strike Engine nicht bekannt, es sollte den Spieler in ein abgelegenes System führen, in dem Vorbereitungen für den Krieg mit den Nephilem stattfinden sollten.

X-Wing Alliance TC

Wing Commander X-Wing Alliance

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Modifikation für: X-Wing Alliance
Status: eingestellt - Beta verfügbar

Diese Total Conversion hat sich vorgenommen, jedes Wing Commander Raumschiff in der Engine von X-Wing Alliance umzusetzen.